《轮回的拉格朗日 第二季》讲述平凡的地球少女京乃圆创立了鸭女Jersey部。某日，圆遇见了一位来自外星的谜之少女兰，一见到她时就觉得很志同道合，便热情邀请她加入Jersey部，因为意想不到能成功招进新部员，圆感到十分高兴。不仅如此，圆的班级里有一名不可思议的转校生麦波，同样来自外星但与兰阵营完全不同的少女麦波也加入了Jersey部。原先只有圆一个人的鸭女Jersey部，一口气增变成了三个人，少女们不平凡的生活就此展开。